水田淹水期通常持续数周到数月，氮素不仅难以吸收利用，而且还会优先进行反硝化作用，大量产生N2及N2O，导致土壤有机质流失，因此需要采用能够降解的氮肥补充。但是淹带水田在使用氮肥时也要选择合适的肥料。
那么在水田淹水期不适用哪种氮肥呢？一些固态氮肥如腐熟厩肥、腐熟鸡粪等，因为它们的速效期较长，在淹水期可能会因为厌氧发酵反应而失去缓释效果。而另一些速效的尿素等氮肥在淹水期容易发生各种气态反应，使大部分的氮素挥发散失，所以尿素也不是淹水期使用的最佳选择。
那在水田淹水期应该如何使用氮肥呢？除了使用淹水田专用氮肥，还可以选择具有缓释效果的氮肥，不便挥发消耗或被土壤氧化的有机氮、尿基氮、脲基氮等有机氮肥，比如说尿素甲醛缩合物等。
在水田淹水期氮肥的选择应该充分考虑氮肥的特性和水稻的需求，在保证高产和稳产的同时，也要尽可能的保护地球生态环境。
